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Snap Gene | 分子生物學(xué)軟件培訓(xùn)
 
   班級人數(shù)--熱線:4008699035 手機:15921673576( 微信同號)
      增加互動環(huán)節(jié), 保障培訓(xùn)效果,堅持小班授課,每個班級的人數(shù)限3到5人,超過限定人數(shù),安排到下一期進行學(xué)習(xí)。
   授課地點及時間
上課地點:【上海】:同濟大學(xué)(滬西)/新城金郡商務(wù)樓(11號線白銀路站) 【深圳分部】:電影大廈(地鐵一號線大劇院站)/深圳大學(xué)成教院 【北京分部】:北京中山學(xué)院/福鑫大樓 【南京分部】:金港大廈(和燕路) 【武漢分部】:佳源大廈(高新二路) 【成都分部】:領(lǐng)館區(qū)1號(中和大道) 【廣州分部】:廣糧大廈 【西安分部】:協(xié)同大廈 【沈陽分部】:沈陽理工大學(xué)/六宅臻品 【鄭州分部】:鄭州大學(xué)/錦華大廈 【石家莊分部】:河北科技大學(xué)/瑞景大廈
開班時間(連續(xù)班/晚班/周末班):2020年3月16日
   課時
     ◆資深工程師授課
        
        ☆注重質(zhì)量 ☆邊講邊練

        ☆若學(xué)員成績達(dá)到合格及以上水平,將獲得免費推薦工作的機會
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   質(zhì)量以及保障

      ☆ 1、如有部分內(nèi)容理解不透或消化不好,可免費在以后培訓(xùn)班中重聽;
      ☆ 2、在課程結(jié)束之后,授課老師會留給學(xué)員手機和E-mail,免費提供半年的課程技術(shù)支持,以便保證培訓(xùn)后的繼續(xù)消化;
      ☆3、合格的學(xué)員可享受免費推薦就業(yè)機會。
      ☆4、合格學(xué)員免費頒發(fā)相關(guān)工程師等資格證書,提升您的職業(yè)資質(zhì)。

課程大綱
 
  • Systat PeakFit是一款功能強大的數(shù)據(jù)峰值擬合軟件,通過該軟件,用戶可以快速的將數(shù)據(jù)導(dǎo)入軟件進行分析,為用戶擬合出各項數(shù)據(jù)的峰值,該軟件支持大多數(shù)數(shù)據(jù)文件格式導(dǎo)入您可以利用軟件中的數(shù)據(jù)掃面功能將該分析數(shù)據(jù)運用在軟件中,當(dāng)您創(chuàng)建一個新的峰值時,可以將計算的數(shù)據(jù)重新導(dǎo)入分析項目,無需完成重建該數(shù)據(jù)的峰值,新版中PeakFit可以自動和準(zhǔn)確地放置正和負(fù)幅度峰值的混合,用戶不需要在進行分類設(shè)置了,非常方便。
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  • 軟件功能
  •   1、PeakFit的參數(shù)約束
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  •   “適應(yīng)首選項”選項包含內(nèi)置參數(shù)約束,這些約束基于與峰的初始位置定義的值的百分比變化。這些約束的默認(rèn)值非常嚴(yán)格,適合提供具有大量明確定義的峰的光譜或色譜數(shù)據(jù)。如果在擬合期間在“約束”字段中看到重復(fù)的非零值,則可能需要打開這些約束或謹(jǐn)慎地禁用它們。
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  •   2.背景配件
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  •   要在后臺執(zhí)行峰擬合,只需將“數(shù)值擬合”或“圖形擬合”窗口進行小化。由于PeakFit使用單獨的和較低優(yōu)先級的適配線程,所以前臺性能不應(yīng)該受到任何影響。
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  •   3.直接刪除峰
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  •   在“自動修正峰”選項中,現(xiàn)在可以直接通過雙擊其主錨點直接刪除峰。也可以使用刪除峰的文檔中描述的步驟,右鍵單擊峰的主錨點,然后在彈出對話框中左鍵單擊“刪除峰”按鈕。
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  •   4.正振幅峰值和負(fù)振幅峰值的混合
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  •   PeakFit現(xiàn)在可以自動和準(zhǔn)確地放置正和負(fù)幅度峰值的混合。此功能存在于AutoFit Peaks I Residuals選項中。只需選中允許負(fù)值。當(dāng)允許負(fù)幅度峰值時,禁用自動添加正殘余峰值的選項。仍然可以通過在期望峰的中心位置附近的殘差圖中點擊來添加單個殘差峰。您可能需要預(yù)先減去基線或使用線性漸進基線選項,因為常數(shù)零二階導(dǎo)數(shù)程序在存在負(fù)振幅峰值時失敗。
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  •   5.部分重新掃描
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  •   當(dāng)您在自動調(diào)整峰值選項之一中創(chuàng)建自定義峰值展示位置時,可以更改控制面板設(shè)置,而無需完全重建峰值。檢測到自定義調(diào)整時,將顯示完全掃描或部分掃描的選項。完整掃描將清除所有自定義調(diào)整。部分掃描將使用當(dāng)前峰值計數(shù)和位置作為新的峰值放置的基礎(chǔ)。除了當(dāng)前默認(rèn)峰類型之外的峰在部分掃描中完全保留。
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  •   6.從AIA文件導(dǎo)入過程數(shù)據(jù)
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  •   AIA包含有效保留時間的過程數(shù)據(jù)的色譜文件可以在任何自動修正峰選項中導(dǎo)入。 “讀取掃描設(shè)置和參數(shù)估計”選項還提供AIA CDF文件類型。只需選擇包含要導(dǎo)入的峰分析結(jié)果的AIA文件(PeakFit將僅使用峰計數(shù)和保留時間值)。包含過程數(shù)據(jù)的文件不需要與數(shù)據(jù)擬合相同,但保留時間必須在要擬合的數(shù)據(jù)的范圍內(nèi),以便作為峰放置。當(dāng)更改導(dǎo)致重新掃描的選項時,必須選擇部分掃描,以保留導(dǎo)入的峰值計數(shù)和位置。如果選中“變化寬度”或“變化形狀”,則這些保留時間將通過PeakFit進一步細(xì)化。
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  •   7.從ASCII文件導(dǎo)入峰值位置
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  •   您還可以創(chuàng)建一個ASCII文件,其中包含您希望PeakFit放置峰的峰位置。這在所有三個AutoFit Peaks選項中可用。 “讀取掃描設(shè)置和參數(shù)估計”選項還提供了用于導(dǎo)入峰值位置的外部列表的ASCII TXT文件類型。使用任何ASCII文本編輯器創(chuàng)建文件,或者您可能希望從自定義程序生成文件。簡單列出峰值位置每行一個。這些位置必須在擬合數(shù)據(jù)的范圍內(nèi)。每當(dāng)發(fā)生重新掃描時,必須選擇部分掃描,以保留導(dǎo)入的峰值計數(shù)和位置。如果選中了變化寬度或變化形狀,這些峰值位置值將通過PeakFit進行細(xì)化。
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  •   8.具有二次模型的非參數(shù)數(shù)字濾波器
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  •   當(dāng)您使用帶有二次模型的PeakFit非參數(shù)數(shù)字濾波器時,建議使用至少5個點的數(shù)據(jù)窗口。對于噪聲數(shù)據(jù),當(dāng)使用4點的小數(shù)據(jù)窗口時可能出現(xiàn)不穩(wěn)定性。
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  •   9.鼠標(biāo)放大復(fù)位
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  •   在PeakFit圖形中單擊鼠標(biāo)右鍵,遠(yuǎn)離數(shù)據(jù)點或峰錨點,現(xiàn)在將僅導(dǎo)致當(dāng)前放大的清除。默認(rèn)縮放的完全重置不再發(fā)生。
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  •   10.數(shù)值摘要中的分析領(lǐng)域
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  •   分析區(qū)域是具有閉合形式解的區(qū)域。 PeakFit對其大多數(shù)峰函數(shù)具有閉合形式的分析面積公式,這些公式在數(shù)值摘要的“測量值”部分中報告。例外是高斯 - 洛倫茲交叉積函數(shù),Pearson IV函數(shù),對稱雙累積,非對稱雙S型和非對稱雙累積。對于這些函數(shù),對于所有峰,分析區(qū)域的“數(shù)值摘要”報告“未知”,并且省略分析面積百分比。對于這些功能,您將需要依靠數(shù)字集成的領(lǐng)域。除非峰具有超出數(shù)據(jù)的X范圍的非常寬的尾部,否則分析和數(shù)字積分區(qū)域?qū)⒒旧舷嗟取?/li>
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  •   11.將數(shù)字摘要添加到打印輸出
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  •   當(dāng)在固定和自定義縱向模式下打印圖形時,此選項可用。數(shù)字摘要直接打印在圖表下方。對于8個或更少的峰,報告兩個擬合參數(shù)和縮寫的測量值。對于超過8個峰,僅打印測量值。字體縮放自動適合指定區(qū)域。此選項僅在PeakFit的審閱中可用。
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  •   12.打印輸出中的線寬
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  •   將圖形打印到高分辨率輸出設(shè)備時,用于繪制峰的單寬度線可能顯得太淺。這些線可以通過增加線寬來變暗。由于該寬度無法在有限的屏幕分辨率內(nèi)有效表示,因此打印預(yù)覽不會反映此線寬設(shè)置。
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  •   13.擬合高斯和洛倫茲導(dǎo)數(shù)
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  •   您現(xiàn)在可以數(shù)字地放置高斯或洛倫茲峰的一階或二階導(dǎo)數(shù)。這些功能只能使用正確的鼠標(biāo)彈出窗口選擇。這些列為D1(高斯放大器),D2(高斯放大器),D1(Lor Amp)和D2(Lor Amp)。函數(shù)必須嚴(yán)格地由基礎(chǔ)高斯或洛倫茲的參數(shù)的數(shù)值設(shè)置。自動放置和圖形調(diào)整不可用。
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  •   作為擬合導(dǎo)數(shù)的替代,您可能希望考慮使用PeakFit的累積面積選項的值,以首先集成數(shù)據(jù),然后使用PeakFit的自動化直接擬合峰。由于導(dǎo)數(shù)中的噪聲通常在綜合基線中產(chǎn)生不尋常的趨勢,因此在擬合之前,您可能希望在AutoFit基線選項中使用PeakFit的非參數(shù)過程。通過僅激活被判斷為表示真實基線的那些點,非參數(shù)模型可以有效地擬合和去除這種類型的基線。數(shù)值摘要的測量值部分將報告基于底層峰值而不是導(dǎo)數(shù)的分析區(qū)域。注意,大多數(shù)測量值僅對峰型數(shù)據(jù)有效,并且在擬合導(dǎo)數(shù)時沒有意義。
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  • 軟件特色
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  •   卷積
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  •   當(dāng)不同的過程根據(jù)兩個不同的和獨立的擴散函數(shù)加寬峰時,所得到的峰被認(rèn)為包括兩種不同功能形式的卷積。卷積的數(shù)學(xué)形式由積分組成:
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  •   例如,許多光譜峰由榷狀態(tài)洛侖茲展寬和獨立的高斯儀器展寬形成。高斯和洛倫茲的卷積是Voigt函數(shù),該模型比包括卷積的各個分量復(fù)雜得多。
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  •   卷積模型
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  •   兩個不同峰值函數(shù)的大多數(shù)卷積對于卷積積分缺少閉合形式解。 PeakFit的內(nèi)置峰值函數(shù)集包含三種具有分析形式的不同卷積模型,光譜函數(shù)集內(nèi)的Voigt,以及色譜函數(shù)中的EMG和GMG。
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  •   卷積模型的獨特之處在于擬合函數(shù)的參數(shù)直接描述了卷積中的分量。這是在峰值擬合內(nèi)實際發(fā)生的唯一的反卷積形式。這是一個最有吸引力的方法,因為它準(zhǔn)確地解決卷積積中的兩個分量,而不會引入噪聲,并且可以重疊和隱藏峰值。
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  •   解卷積
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  •   解卷積本質(zhì)上是卷積的撤銷或逆轉(zhuǎn)。它通常在傅里葉域中用離散數(shù)據(jù)完成,并且通常去除儀器響應(yīng)函數(shù)。反卷積的FFT形式涉及必須使用一些有效形式的頻域過濾來處理的噪聲的主要引入。
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  •   儀器響應(yīng)函數(shù)
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  •   當(dāng)不完全的測量儀器有助于峰值展寬時,描述該效應(yīng)的函數(shù)被稱為儀器響應(yīng)函數(shù)。大多數(shù)去卷積的目的是去除器械拖尾,以便產(chǎn)生沒有儀器失真的信號信號。
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  •   解卷積光譜或高斯儀器響應(yīng)函數(shù)
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  •   大多數(shù)光譜儀器響應(yīng)函數(shù)在形式上傾向于是高斯的。因此,大多數(shù)光譜峰將由它們的榷狀態(tài)洛倫茲形式和該高斯拖尾的卷積組成。獨立的高斯和洛倫茲展寬可以通過擬合Voigt模型來解決。您還可以通過使用高斯響應(yīng)函數(shù)對傅里葉域中的數(shù)據(jù)進行第一反卷積來去除高斯拖尾。
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  •  “準(zhǔn)備菜單”中的Deconvolve Gaussian IRF選項提供了一個自動化的FFT高斯反卷積程序,可用于在擬合之前刪除儀器效應(yīng)。
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  • 運行PeaKFit的最低要求:
  • 硬件:
  • 486處理器或更高
  • 需要16 MB RAM(建議32MB或更多)
  • 10MB硬盤空間
  • 軟件:
  • Windows 10,8.x,7,Windows Vista,95,98,NT和XP(32位)
 
 
  備案號:備案號:滬ICP備08026168號-1 .(2024年07月24日)....................
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